تتمثل أهم الأهداف التي تسعى وكالة الدراسات العليا والبحث العلمي بجامعة شقراء إلى تحقيقها بإذن الله تعالى في النقاط التالية:

• خلق بيئة بحثية محفزة على الابداع والابتكار.
• بناء جسور للتواصل بين الجامعة والمجتمع من خلال توجيه البحث العلمي لتنمية المجتمع.
• تقديم برامج نوعية للدراسات العليا تسهم في تحقيق التنمية المستدامة.
• بناء شراكات بين الجامعة والجامعات الأخرى المحلية والعالمية.
• توفير مصادر المعلومات الأكاديمية.
• استقطاب أعضاء هيئة تدريس من ذوي الكفاءة العالية.
• تقديم فرص الابتعاث والتدريب لطلاب وطالبات الجامعة بمهنية عالية.
• دعم وتشجيع الترجمة والنشر في الجامعة. 

انطلاقاً من قيم ديننا الحنيف وثقافتنا الغراء، فإننا نؤمن بالقيّم التالية:

• الجودة: الجودة في تنفيذ أهداف الوكالة والعمادات والإدارات التابعة لها.
• القيادة والعمل بروح الفريق:
• ترسيخ الأدوار القيادية الفردية، والمؤسسية، والعمل بروح الفريق الواحد.
• الشفافية: الشفافية في جميع أعمال الوكالة والعمادات والإدارات التابعة لها.