ويعد مجلس الجامعة السلطة العليا والمهيمنة على شؤون الجامعة وله وضع السياسة التي تسير عليها، إضافة إلى توليه تصريف الشؤون العلمية، والإدارية، وتنفيذ السياسة العامة للجامعة. واتخاذ ما يراه مناسباً من القرارات لتحقيق الغرض الذي قامت من أجله الجامعة بالذات في مجال إنشاء الكليات والأقسام الجديدة واقتراح ميزانية الجامعة ونظام المرتبات والمكافآت لأعضاء هيئة التدريس.
ويعد مجلس الجامعة جزء من المنظومة الكبيرة لجامعة شقراء والتي تسعى دوما وأبداً مع باقي أجزاء هذه المنظومة بالإسهام في تحقيق الأهداف الجامعية التي أنشئت من اجلها الجامعة وبما هو متاح لها من مهام وادوار تنفيذية.. لذلك فإن الأهداف الخاصة لأمانة مجلس الجامعة منسجمة تماما مع الأهداف العامة لجامعة شقراء فكل ما يبذل من جهود وما يمارس من ادوار إدارية وفنية بمختلف إجراءاتها داخل هذه الإدارة يصب في مسار سعي الجامعة الدءوب نحو تحقيق تلك الأهداف العريضة، والإسهام في تطوير التعليم العالي.