أمانة مجلس الجامعة هي الجهة التي تتولى مباشرة الأعمال التحضيرية والإجرائية لانعقاد مجلس الجامعة ، و يتولى سعادة الأستاذ الدكتور/ محمد بن إبراهيم الدغيري وكيل الجامعة للدراسات العليا والبحث العلمي منصب أمين مجلس الجامعة .
يعقد مجلس الجامعة مرة في كل شهر ، لاتخاذ القرارات الخاصة بالجامعة وذلك برئاسة وزير التعليم ، وحضور سعادة الأمين العام لمجلس شؤون الجامعات، ويتولى رئيس الجامعة منصب نائب الرئيس ، كما يتولى وكيل الجامعة للدراسات العليا والبحث العلمي منصب أمين مجلس الجامعة ، ويتكون أعضاؤه من وكلاء الجامعة وعمداء الكليات والعمادات المساندة .
وذلك من خلال القيام بالمهام التالية :
- تلقي المواضيع المطلوب عرضها على مجلس الجامعة والتأكد من إستكمالها للإجراءات النظامية وذلك تمهيدا لإعداد المذكرات الخاصة بها من الموظف المنوط به ذلك .
- نسخ المذكرات المطلوب عرضها على مجلس الجامعة وذلك بعد التأكد من إستكمالها للشكل النظامي وعرضها على صاحب الصلاحية ومن ثم إعداد جدول الأعمال بناء عليها .
- نسخ محاضر الجلسات بعد إعدادها وعرضها على صاحب الصلاحية للتوقيع .
- إعداد الخطابات التنفيذية للقرارات الصادرة من مجلس الجامعة تمهيدا لتوقيعها من صاحب الصلاحية .
- تبليغ القرارات التنفيذية بعد توقيعها الى الجهات المعنية بها لتنفيذها ، مع ارسال صور منها الى الإدارة المعنية لتنفيذها.
- إعداد تقارير متابعة دورية للقرارات الصادرة من مجلس الجامعة تبين ما تم تنفيذه ومالم يتم تنفيذه من تلك القرارات والأسباب التي أدت الى ذلك والرفع لصاحب الصلاحية للتوجيه بما يلزم .
- إعداد بيان بعدد الجلسات التي حضرها أعضاء مجلس الجامعة لإستكمال الإجراءات النظامية لصرف المكافأة المستحقة لكل عضو .
- إعداد صور من محاضر مجلس الجامعة وإرسالها الى مكتب سعادة رئيس الجامعة ووكلائها والعمداء والإدارة القانونية .
- إعداد فهرس موضوعي لقرارات مجلس الجامعة وحفظ محاضر الجلسات والمذكرات الخاصة به في حافظة خاصة بذلك .
- رفع المراسلات الخارجية فيما يتعلق بمخاطبة الوزراء ومن في حكمهم الى رئيس الجامعة لتوقيعها ومن يفوضه بذلك.