هو المجلس المعني بجميع شؤون الجامعة ويرأسه معالي وزير التعليم، ومعالي رئيس الجامعة (نائباً للرئيس) وعضوية وكلاء الجامعة وأمين مجلس التعليم العالي والعمداء و ثلاثة من ذوي الخبرة يعينهم وزير التعليم لمدة ثلاث سنوات. (المادة التاسعة عشرة من نظام مجلس التعليم العالي والجامعات).
ويعد مجلس الجامعة جزء من المنظومة الكبيرة لجامعة شقراء والتي تسعى دوما وأبداً مع باقي أجزاء هذه المنظومة بالإسهام في تحقيق الأهداف الجامعية التي أنشئت من اجلها الجامعة وبما هو متاح لها من مهام وادوار تنفيذية.. لذلك فإن الأهداف الخاصة لأمانة مجلس الجامعة منسجمة تماما مع الأهداف العامة لجامعة شقراء فكل ما يبذل من جهود وما يمارس من ادوار إدارية وفنية بمختلف إجراءاتها داخل هذه الإدارة يصب في مسار سعي الجامعة الدءوب نحو تحقيق تلك الأهداف العريضة، والإسهام في تطوير التعليم العالي.